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免疫沉淀——質(zhì)譜聯(lián)用揭示RCC2在乳腺癌MDA-MB-468細(xì)胞系中的新功能
陳震; 陳恒星; 胡開順 中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究中心; 廣州510120
- rcc2
- 乳腺癌
- 蛋白翻譯
摘要：目的分析RCC2蛋白在乳腺癌MDA-MB-468細(xì)胞系中的互作蛋白組并揭示其功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法運(yùn)用酶切技術(shù)結(jié)合一代測(cè)序構(gòu)建攜帶Flag標(biāo)簽RCC2蛋白過表達(dá)載體,慢病毒包裝感染構(gòu)建Flag-RCC2過表達(dá)的MDA-MB-468穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株。采用Flag抗體凝膠珠親和沉淀,收集蛋白樣品進(jìn)行高敏感度質(zhì)譜鑒定。生物信息蛋白組學(xué)分析互作蛋白組,包括GO注釋,KEGG通路富集,構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPIN)。結(jié)果高可信度164個(gè)蛋白聚類分析顯示,RCC2及其互作蛋白顯著富于核糖體相關(guān)通路中,具有RNA與核蛋白體結(jié)合能力,揭示其參與蛋白翻譯與成熟的過程。結(jié)論成功鑒定RCC2互作蛋白組,揭示RCC2在乳腺癌細(xì)胞中發(fā)揮新的翻譯調(diào)控功能。
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- 乳腺癌
- 蛋白翻譯
摘要：目的分析RCC2蛋白在乳腺癌MDA-MB-468細(xì)胞系中的互作蛋白組并揭示其功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法運(yùn)用酶切技術(shù)結(jié)合一代測(cè)序構(gòu)建攜帶Flag標(biāo)簽RCC2蛋白過表達(dá)載體,慢病毒包裝感染構(gòu)建Flag-RCC2過表達(dá)的MDA-MB-468穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株。采用Flag抗體凝膠珠親和沉淀,收集蛋白樣品進(jìn)行高敏感度質(zhì)譜鑒定。生物信息蛋白組學(xué)分析互作蛋白組,包括GO注釋,KEGG通路富集,構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPIN)。結(jié)果高可信度164個(gè)蛋白聚類分析顯示,RCC2及其互作蛋白顯著富于核糖體相關(guān)通路中,具有RNA與核蛋白體結(jié)合能力,揭示其參與蛋白翻譯與成熟的過程。結(jié)論成功鑒定RCC2互作蛋白組,揭示RCC2在乳腺癌細(xì)胞中發(fā)揮新的翻譯調(diào)控功能。
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腫瘤防治研究
- 預(yù)計(jì)1-3個(gè)月 預(yù)計(jì)審稿周期
- 1.34 影響因子
- 醫(yī)學(xué) 快捷分類
- 月刊 出版周期
主管單位：湖北省衛(wèi)生健康委員會(huì);主辦單位：湖北省腫瘤醫(yī)院; 中國抗癌協(xié)會(huì)
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