首頁 > 期刊 > 自然科學與工程技術 > 農(nóng)業(yè)科技 > 畜牧與動物醫(yī)學 > 畜禽業(yè) > 雉雞SSR分子標記開發(fā) 【正文】
摘要:目的進行雉雞SSR分子標記的開發(fā)。方法在雉雞分子標記未知的情況下,采用454測序平臺結合SSR富集文庫測序的高通量測序方法進行雉雞SSR分子標記的開發(fā),對測序數(shù)據(jù)進行分析與篩選。結果獲得如下結果:①原始數(shù)據(jù)經(jīng)質量過濾后的總reads數(shù)為289008條,總堿基數(shù)為109667298個,含有SSR位點的序列數(shù)為48168條;②單核苷酸重復SSR到六核苷酸重復SSR在雉雞基因組中均有分布。其中單核苷酸重復SSR數(shù)目最多,達25648個,占SSR位點總數(shù)的39.33%;雙核苷酸和三核苷酸SSR數(shù)量亦較豐富,分別為19618和9299個,占SSR位點總數(shù)的30.08%和14.26%;而四核苷酸至六核苷酸重復SSR數(shù)目較少,三者的總和為10651個,其中六核苷酸重復序列最少,僅為603個。結論通過雉雞SSR分子標記數(shù)據(jù)庫的構建,為雉雞種質資源遺傳多樣性分析、分子標記輔助育種、遺傳圖譜構建和功能基因的挖掘等提供了有利工具。
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