貝氏柯克斯體九里株Ⅱ相突變體的克隆與鑒定

何澤民; 孫志會; 于永慧; 羅聲棟; 王益清; 王景林; 姜永強; 宋立華病原微生物生物安全國家重點實驗室; 軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院微生物流行病研究所; 北京100071; 解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心臨床研究管理中心; 北京100039

貝氏柯克斯體
q熱
全基因組測序
適應(yīng)性變異

摘要：目的:克隆分離國內(nèi)貝氏柯克斯體九里株Ⅱ相突變體,并利用基因組測序方法進(jìn)行鑒定,為貝氏柯克斯體研究提供參考依據(jù)。方法:用半固體平板法克隆分離貝氏柯克斯體,對隨機選擇的克隆株CB01進(jìn)行全基因組測序分析,將測序結(jié)果與國外貝氏柯克斯體不同克隆株的基因組進(jìn)行比較分析。結(jié)果:CB01的基因組全長2.024Mb,包含1個1.987Mb的環(huán)狀染色體和1個37.321kb的質(zhì)粒。與九里株Ⅰ相菌(RSA493克隆)基因組相比,CB01多出5個重復(fù)序列,有1個25997bp的刪除區(qū),23個單核苷酸多態(tài)性位點(SNP)差異。與九里株Ⅱ相菌(RSA439克隆)基因組相比,CB01同樣多出5個重復(fù)序列,但僅有6個SNP差異。CB01與RSA439的CBU_0533基因序列完全相同,可解釋CB01缺失O抗原從而成為Ⅱ相菌。結(jié)論:貝氏柯克斯體九里株Ⅱ相菌克隆CB01與國外Ⅱ相菌RSA439高度同源,CB01可用做國內(nèi)貝氏柯克斯體研究用參考菌株。

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