電離輻射對(duì)人舌鱗癌CAL-27細(xì)胞影響的生物信息學(xué)分析

胡松玲; 胡慶玲; 王衛(wèi)平; 何祥一; 黨秉榮; 邵春林復(fù)旦大學(xué)放射醫(yī)學(xué)研究所; 上海200032; 蘭州大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)研究所; 蘭州730000; 中國(guó)科學(xué)院近代物理研究所; 蘭州730000; 德州市人民醫(yī)院口腔科; 德州253000

重離子
microrna
輻射

摘要：通過(guò)生物信息學(xué)方法分析不同輻射源照射對(duì)人舌鱗癌CAL-27細(xì)胞基因表達(dá)譜的影響,為臨床篩選口腔腫瘤放射治療相關(guān)分子標(biāo)志物提供參考.利用X射線和重離子照射CAL-27細(xì)胞,運(yùn)用克隆存活實(shí)驗(yàn)及流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞存活率及凋亡率;進(jìn)一步應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)篩選受照射細(xì)胞差異表達(dá)的miRNAs,并對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行生物學(xué)功能及代謝通路富集分析,以探討其分子損傷機(jī)理.結(jié)果表明,X射線及重離子照射CAL-27細(xì)胞后,細(xì)胞存活率分別為88%、71%,細(xì)胞凋亡率分別為13.9%、30.4%.通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)分析發(fā)現(xiàn),與X射線輻照組相比,重離子輻照組共有33個(gè)miRNAs表達(dá)差異,其中有12個(gè)miRNAs表達(dá)上調(diào),21個(gè)miRNAs表達(dá)下調(diào);通過(guò)KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)數(shù)據(jù)庫(kù)在表達(dá)差異的miRNAs中篩選出了15條相關(guān)信號(hào)通路,如嗅覺傳導(dǎo)通路、細(xì)胞因子受體交互通路、絲裂原活化蛋白激酶信號(hào)通路等.結(jié)果提示,在相同吸收劑量條件下,相比于X射線,重離子輻射對(duì)CAL-27細(xì)胞miRNA表達(dá)譜的影響較大,其變化機(jī)理可能與MAPK信號(hào)傳導(dǎo)通路有關(guān).

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