首頁(yè) > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 農(nóng)業(yè)科技 > 農(nóng)業(yè)綜合 > 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) > 雙孢蘑菇6個(gè)菌株不同發(fā)育階段的轉(zhuǎn)錄組分析 【正文】
摘要:【目的】通過(guò)多個(gè)雙孢蘑菇菌株不同發(fā)育階段的差異轉(zhuǎn)錄組分析,為進(jìn)一步驗(yàn)證雙孢蘑菇發(fā)育相關(guān)基因及探討其分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)?!痉椒ā繉?duì)雙孢蘑菇主栽品種As2796及其親本02、8213,其回交子代W192,以及國(guó)外野生菌株ARP159、國(guó)內(nèi)野生菌株AgLH830共6個(gè)具有重要代表性的菌株子實(shí)體原基期、幼菇期、采摘期、開傘期等4個(gè)不同發(fā)育階段共24個(gè)樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并與雙孢蘑菇參考基因組序列進(jìn)行比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行各基因在不同樣品中的表達(dá)量分析及差異表達(dá)基因識(shí)別,發(fā)掘新基因與共同基因的差異表達(dá),并進(jìn)行各數(shù)據(jù)庫(kù)的基因功能注釋?!窘Y(jié)果】結(jié)果共鑒定到10 660個(gè)轉(zhuǎn)錄本,發(fā)掘新基因677個(gè),其中237個(gè)得到功能注釋。與原基期相比,6個(gè)菌株在幼菇期、采摘期和開傘期分別有49、82、73個(gè)共同差異表達(dá)基因,其中有13個(gè)是相同的基因?!窘Y(jié)論】發(fā)現(xiàn)了一批在雙孢蘑菇子實(shí)體不同發(fā)育階段具有顯著差異表達(dá)的基因,篩選出不同菌株不同階段的共有差異基因,對(duì)雙孢蘑菇子實(shí)體發(fā)育中重要的差異基因進(jìn)行了注釋與探討。
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